Non si può dire se si tratta di ipovitaminosi o altro, soprattutto senza vedere almeno una foto. In ogni caso una diagnosi del genere è meglio se la fa un veterinario specializzato in rettili.
Quello che ti posso consigliare è intanto di migliorare e variare l'alimentazione, leggi qui:
viewtopic.php?f=36&t=16628L'acqua non la devi cambiare spesso, perchè può essere motivo di stress per la tartaruga; l'acquario deve essere munito di un filtro che matenga pulita l'acqua almeno per un mese. E non c'è bisogno che la pulisci con uno spazzolino (soprattutto se è piccola, se ha il carapace ancora relativamente "morbido" potresti farle male).
Per il resto ti invito a leggere le varie discussioni presenti sul forum e anche le schede che puoi trovare nella homepage del sito, ci sono molte informazioni utili.